MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020834	ATT	2	6	180235	180240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335422
3502	NC_020834	ATT	2	6	180294	180299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335422
3503	NC_020834	CAA	2	6	180315	180320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335422
3504	NC_020834	GTG	2	6	180337	180342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335422
3505	NC_020834	CGTG	2	8	180364	180371	0 %	25 %	50 %	25 %	472335422
3506	NC_020834	CGCC	2	8	180417	180424	0 %	0 %	25 %	75 %	472335422
3507	NC_020834	GTGC	2	8	180457	180464	0 %	25 %	50 %	25 %	472335422
3508	NC_020834	CAG	2	6	180590	180595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335422
3509	NC_020834	CTT	2	6	180714	180719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335422
3510	NC_020834	AGA	2	6	180741	180746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335422
3511	NC_020834	CAATAA	2	12	180829	180840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	472335422
3512	NC_020834	AAT	2	6	180847	180852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020834	T	6	6	180908	180913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020834	ATT	2	6	180938	180943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
3515	NC_020834	TAC	2	6	180998	181003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3516	NC_020834	TGC	2	6	181013	181018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335423
3517	NC_020834	TTA	2	6	181024	181029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
3518	NC_020834	TAT	2	6	181082	181087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
3519	NC_020834	TGG	2	6	181127	181132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335423
3520	NC_020834	ATA	2	6	181171	181176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335423
3521	NC_020834	TAC	2	6	181196	181201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3522	NC_020834	AGC	2	6	181237	181242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335423
3523	NC_020834	GTT	2	6	181276	181281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335423
3524	NC_020834	TCA	2	6	181369	181374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3525	NC_020834	ACA	2	6	181399	181404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335423
3526	NC_020834	CAGAGG	2	12	181487	181498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472335423
3527	NC_020834	ATC	2	6	181527	181532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3528	NC_020834	TAGACC	2	12	181539	181550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472335423
3529	NC_020834	CTT	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335423
3530	NC_020834	TGC	2	6	181632	181637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335423
3531	NC_020834	T	6	6	181655	181660	0 %	100 %	0 %	0 %	472335423
3532	NC_020834	AT	3	6	181688	181693	50 %	50 %	0 %	0 %	472335423
3533	NC_020834	AGT	2	6	181722	181727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335423
3534	NC_020834	T	7	7	181774	181780	0 %	100 %	0 %	0 %	472335423
3535	NC_020834	AGAC	2	8	181889	181896	50 %	0 %	25 %	25 %	472335423
3536	NC_020834	TAGCTT	2	12	181916	181927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472335423
3537	NC_020834	T	6	6	181951	181956	0 %	100 %	0 %	0 %	472335423
3538	NC_020834	CCA	2	6	181969	181974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335423
3539	NC_020834	GCC	2	6	182005	182010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335423
3540	NC_020834	TCCCA	2	10	182049	182058	20 %	20 %	0 %	60 %	472335423
3541	NC_020834	TCA	2	6	182063	182068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3542	NC_020834	GA	3	6	182145	182150	50 %	0 %	50 %	0 %	472335423
3543	NC_020834	TTA	2	6	182251	182256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335424
3544	NC_020834	ATA	2	6	182286	182291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3545	NC_020834	ATA	3	9	182306	182314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3546	NC_020834	AAT	2	6	182339	182344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3547	NC_020834	CAG	2	6	182461	182466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335424
3548	NC_020834	GATT	2	8	182505	182512	25 %	50 %	25 %	0 %	472335424
3549	NC_020834	T	6	6	182511	182516	0 %	100 %	0 %	0 %	472335424
3550	NC_020834	TAA	2	6	182533	182538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3551	NC_020834	TCA	2	6	182544	182549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335424
3552	NC_020834	CTT	2	6	182712	182717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335424
3553	NC_020834	A	9	9	182751	182759	100 %	0 %	0 %	0 %	472335424
3554	NC_020834	TAA	2	6	182763	182768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3555	NC_020834	GC	3	6	182812	182817	0 %	0 %	50 %	50 %	472335424
3556	NC_020834	AAG	2	6	182876	182881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335424
3557	NC_020834	ATG	2	6	182912	182917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335424
3558	NC_020834	AGG	2	6	182941	182946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335424
3559	NC_020834	GGC	2	6	182998	183003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335424
3560	NC_020834	AG	3	6	183121	183126	50 %	0 %	50 %	0 %	472335424
3561	NC_020834	AAG	2	6	183151	183156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335424
3562	NC_020834	AGG	2	6	183159	183164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335424
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3564	NC_020834	ATA	2	6	183215	183220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3565	NC_020834	TAA	2	6	183270	183275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3566	NC_020834	ATA	2	6	183359	183364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3567	NC_020834	GAA	2	6	183365	183370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335424
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3569	NC_020834	TTG	2	6	183486	183491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335424
3570	NC_020834	CAAA	2	8	183670	183677	75 %	0 %	0 %	25 %	472335425
3571	NC_020834	AGA	2	6	183679	183684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335425
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3573	NC_020834	TTC	2	6	183758	183763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335425
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3575	NC_020834	TAAATT	2	12	183866	183877	50 %	50 %	0 %	0 %	472335425
3576	NC_020834	AAT	2	6	183885	183890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3577	NC_020834	ATA	3	9	183915	183923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
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3580	NC_020834	TAA	2	6	184081	184086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3581	NC_020834	AATG	2	8	184107	184114	50 %	25 %	25 %	0 %	472335425
3582	NC_020834	ACC	2	6	184119	184124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335425
3583	NC_020834	TAA	2	6	184139	184144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3584	NC_020834	TTA	2	6	184294	184299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020834	T	6	6	184317	184322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020834	ATCT	2	8	184411	184418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_020834	GTAC	2	8	184432	184439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_020834	GAA	2	6	184446	184451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_020834	TTTA	2	8	184482	184489	25 %	75 %	0 %	0 %	472335426
3590	NC_020834	GAGT	2	8	184508	184515	25 %	25 %	50 %	0 %	472335426
3591	NC_020834	TTA	2	6	184580	184585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335426
3592	NC_020834	AAG	2	6	184628	184633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335426
3593	NC_020834	TGAA	2	8	184661	184668	50 %	25 %	25 %	0 %	472335426
3594	NC_020834	GCGT	2	8	184721	184728	0 %	25 %	50 %	25 %	472335426
3595	NC_020834	TTA	2	6	184808	184813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_020834	CAA	2	6	184843	184848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335427
3597	NC_020834	GAGC	2	8	184935	184942	25 %	0 %	50 %	25 %	472335427
3598	NC_020834	T	6	6	184943	184948	0 %	100 %	0 %	0 %	472335427
3599	NC_020834	AAGCCA	2	12	185007	185018	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472335427
3600	NC_020834	TGG	2	6	185057	185062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335427
3601	NC_020834	TGA	2	6	185208	185213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335427
3602	NC_020834	GAT	2	6	185238	185243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335427
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3604	NC_020834	ATT	2	6	185613	185618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335427
3605	NC_020834	TAG	2	6	185625	185630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335427
3606	NC_020834	CCA	2	6	185636	185641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335427
3607	NC_020834	CCCA	2	8	185696	185703	25 %	0 %	0 %	75 %	472335427
3608	NC_020834	AGA	2	6	185762	185767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335428
3609	NC_020834	ACT	2	6	185794	185799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335428
3610	NC_020834	AAAG	2	8	185832	185839	75 %	0 %	25 %	0 %	472335428
3611	NC_020834	T	6	6	185879	185884	0 %	100 %	0 %	0 %	472335428
3612	NC_020834	TCA	2	6	185908	185913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335428
3613	NC_020834	T	6	6	185928	185933	0 %	100 %	0 %	0 %	472335428
3614	NC_020834	TC	3	6	185967	185972	0 %	50 %	0 %	50 %	472335428
3615	NC_020834	GAT	2	6	186045	186050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335428
3616	NC_020834	ATA	2	6	186079	186084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335428
3617	NC_020834	ATA	2	6	186097	186102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335428
3618	NC_020834	GGT	2	6	186185	186190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020834	A	7	7	186218	186224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_020834	CTG	2	6	186226	186231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_020834	GGA	2	6	186258	186263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_020834	TCC	2	6	186338	186343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_020834	TG	3	6	186365	186370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_020834	CTG	2	6	186390	186395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3876	NC_020834	TAAA	2	8	197860	197867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3877	NC_020834	CATAT	2	10	197928	197937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3878	NC_020834	CATTT	2	10	197938	197947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3879	NC_020834	A	6	6	197950	197955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3880	NC_020834	TCA	2	6	197977	197982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3895	NC_020834	CT	4	8	199136	199143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3896	NC_020834	TC	4	8	199175	199182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3897	NC_020834	GA	3	6	199192	199197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3898	NC_020834	T	7	7	199215	199221	0 %	100 %	0 %	0 %	472335444
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3982	NC_020834	ATTGA	2	10	203581	203590	40 %	40 %	20 %	0 %	472335447
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3985	NC_020834	TTAAAC	2	12	203711	203722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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